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华大基因团队借助SpatialGlue图神经网络模型,揭示生物复杂性的解剖细节:多组学数据整合研究登上Nature子刊

在生物样本分析领域,继单细胞转录组学之后,KX空间转录组学带来了新的突破。新加坡科技研究局(A*STAR)、华大基因和上海交通大学医学院附属仁济医院等机构的研究团队,开发出了一款名为SpatialGlue的图神经网络模型,该模型具备双注意力机制,能以空间感知方式整合多组学数据。SpatialGlue有效地将不同数据模态与其相应空间背景结合,揭示组织样本的组织学结构。相较于其他方法,SpatialGlue能捕获更多解剖细节,更精确解析空间域,如大脑皮层。 该模型在处理空间多组学数据时,识别了脾脏巨噬细胞亚群等原始数据未标注的...