标签:空间转录组学

新SOTA,仅几个标记基因即可自动标记,复旦大学开发空间转录组学语义注释贝叶斯框架

复旦大学的科研团队推出了一款名为 Pianno 的创新工具,用于自动化空间转录组学的结构语义注释。Pianno 是一个基于贝叶斯框架的系统,能有效注释各种空间语义,包括解剖结构和复杂的肿瘤微环境,并能估计跨平台的细胞类型分布。通过对人类新皮质深层区域的分析,Pianno 揭示了区域和物种特异性的兴奋性神经元亚型,展现了细胞进化的洞察。 Pianno 的工作流程包括初始分割和细化两个步骤,使用预定义的标记基因来自动识别模式。它通过概率框架和贝叶斯分类器优化注释过程,减少了对已知标记基因数量的需求。在评估中,Pianno...