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南加州大学团队运用DeepPBS与几何深度学习技术进行蛋白质-DNA结合特性的预测和结构分析

预测蛋白质与DNA的结合特性是解析基因调控机制的重要环节。鉴于此,南加州大学(University of Southern California)与华盛顿大学(University of Washington)的研究团队开发了一种名为DeepPBS(深度结合特异性预测器)的几何深度学习模型。这项技术旨在通过蛋白质-DNA复合物的结构信息来预测其结合特性。该研究成果已于2024年8月5日在《Nature Methods》杂志上发表。 转录因子通过与特定DNA序列的结合来调控生命活动,这种结合涉及多种机制,如静电相互作用、脱氧核糖堆积效应及氢键形成等。蛋白质-DNA复合物的结构信息...