标签:蛋白质语言模型
首次,西湖大学用蛋白质语言模型定向改造碱基编辑器,登Cell子刊
西湖大学的研究团队在基因组编辑领域取得重大突破,他们利用蛋白质语言模型(PLM)优化了尿嘧啶-N-糖基化酶(UNG)变体,开发出新型碱基编辑器TSBE,能有效实现T到G或T到C的精准编辑。传统的碱基编辑器如CBE和ABE依赖于脱氨反应,但无法诱导所有类型的点突变,特别是颠换突变。研究团队通过调整UDG的底物特异性,创造出CDG和TDG,这两者在nCas9和sgRNA引导下可切割T或C碱基,促进高效的颠换突变。 在实验中,研究人员发现将CDG和TDG与SpCas9n融合时,编辑效率有所不同。通过将蛋白质语言模型应用于TDG的突变体设计,显著提...